Laboratório de Bioinformática Estrutural e Biologia Computacional

Instituição: Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Cidade/UF: RS/9500

O Laboratório atua no campo da Bioinformática, Ciência de Dados, Aprendizado de Máquina, Métodos de Busca Heurística e Processamento Massivamente Paralelo. As técnicas desenvolvidas são aplicadas em problemas de atracamento molecular, modelagem 3D de proteínas, simulações por dinâmica molecular, análise de dados genômicos e transcriptômicos, biologia de sistemas, redes de coexpressao, redes iteração proteína-proteína e regulação pós-transcricional.

Áreas de atuação

• Bioinformática
• Biofísica de proteínas
• Biologia Molecular e celular
• Genética
• Ciencias Biológicas
• Genética forense
• Medicina personalizada
• novas drogas
• Biotecnologia

Técnicas disponíveis

• Dinâmica molecular
• Processamento em unidades gráficas (GP-GPU)
• Aprendizado de Máquina
• Data Science
• Algoritmos de Otimização
• Metaheurísticas
• Análise transcriptômica
• Análise bioinformática dos dados de NGS
• Interpretabilidade dos modelos computacionais
• Genômica e Metagenômica
• Biologia de Sistemas

Equipamentos

• HP ProLiant ML310E Gen8 Server — HP ProLiant ML310e Gen8
• HP ProLiant ML310e Gen8 Server — HP ProLiant ML310e Gen8
• HP ProLiant ML350e Gen8 Server — HP ProLiant ML350e Gen8
• Lenovo ThinkSystem DE2000H Hybrid Storage Array — IBM Lenovo ThinkSystem DE2000H
• Lenovo ThinkSystem SR650 Server — IBM Lenovo ThinkSystem SR650
• Nobreak NHS Laser Prime Senoidal 3000VA — NHS Laser Prime Senoidal 3000VA
• SILIX Server AMD EPYC 7453 — SILIX 0002169
• Storage Asustor Lockerstor 8 — Asustor LOCKERSTOR 8 AS6508T
• Switch Gerenciável Gigabit — GigabitTL-SG3428X TL-SG3428X
• System x3650 M5 Rack Server — IBM Lenovo System x3650
• System x3650 M5 Rack Server — IBM Lenovo System x3650
• TS-1673AU-RP - Qnap — QNAP TS-1673AU-RP
• TS-h1886XU-RP R2 Qnap — QNAP TS-h1886XU-RP R2

Dados extraídos do PNIPE/MCTI.