Plataforma de Bioinformática Fiocruz-Rio de Janeiro RPT04A

Instituição: Fundação Oswaldo Cruz

Cidade/UF: RJ/4036

Localizada no Instituto Oswaldo Cruz - IOC Fiocruz RJ, disponibilizamos acesso a computação em alto desempenho. Configuração: A - 03 CPU-nodes, cada um com duas CPUs AMD EPYC7662 (128 cores) e 512GB RAM DDR4; B - 02 FAT-nodes, cada um com duas CPUs AMD EPYC7763 (128 cores) e 4TB de RAM DDR4; C - 02 GPU-nodes, cada um com duas GPUs NVIDIA A100 40GB, duas CPUs AMD EPYC7762 (128 cores) e 512GB de RAM DDR4. Os programas são disponibilizados como módulos de ambiente.

Áreas de atuação

• Bioinformática

Técnicas disponíveis

• Modelagem molecular
• Dinâmica molecular
• polimorfismo genéticos
• Biologia estrutural
• Análise bioinformática dos dados de NGS
• análises genômicas e metagenômicas
• Análises transcriptômicas
• Análise de Bioinformática e Multiômica
• Análises de bioinformática diversas
• Análise de bioinformática
• Montagem de genomas
• Docking molecular

Equipamentos

• HPC Rieux — ATOS/EVIDEN/Supermicro Customizado

Dados extraídos do PNIPE/MCTI.