Laboratório de Sequenciamento em Larga Escala

Instituição: Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo

Cidade/UF: SP/255

O laboratório de Sequenciamento em Larga Escala (SELA) da Rede PREMiUM tem por finalidade realizar sequenciamento em larga escala para pesquisadores da Faculdade de Medicina e do Hospital das Clínicas da FMUSP assim como para outras entidades de ensino e pesquisa. Os equipamentos e seus acessórios foram obtidos por meio de Auxílio a Pesquisa - Equipamentos Multiusuários da FAPESP (n. 14/50137-5 e 2021/15079-8), MCTI/FINEP/CT-Infra-PROINFRA 01/2011 (n.0160/12-sp02).

Áreas de atuação

• Nefrologia
• Genética
• Neurologia
• Biologia molecular
• Endocrinologia

Técnicas disponíveis

• Sequenciamento de nova geração (NGS)
• Quantificação de DNA e RNA
• Análise de qualidade de DNA e RNA
• Análise de qualidade de bibliotecas
• Análise bioinformática dos dados de NGS
• Fragmentação de DNA e de cromatina para ChIP por ultrassonicação
• Sequenciamento de painéis customizados
• Sequenciamento de exomas
• Sequenciamento de RNA
• Sequenciamento de célula única

Equipamentos

• Aria Mx — Agilent Technologies Mx
• Concentrador plus — Eppendorf Concentrador plus
• Fragment Analyzer — Agilent Technologies Fragment Analyzer
• MiSeq — Illumiina MiSeq
• MiSeq i100 plus — Illumina Série MiSeq i100 plus
• NextSeq 2000 — Illumina NextSeq 2000
• NextSeq 550 — Illumina NextSeq 550
• Plataforma de pipetagem líquida automática Bravo NGS B — Agilent Technologies G5522A-NGS
• RotoBot — Benchmark Scientific R4040
• Tape Station 4200 — Agilent Techanologies 4200
• Termociclador Vapo.protect — Eppendorf Vapo.protect
• Ultrassonicador Covaris E220 — Covaris E220

Dados extraídos do PNIPE/MCTI.